Populációgenetikai szoftver hatékonyságának növelése

Kiss, Máté Szabolcs (2022) Populációgenetikai szoftver hatékonyságának növelése. BA/BSc, Faipari Mérnöki és Kreatívipari Kar (2013-tól 2021.06.30-ig: Simonyi Károly Műszaki, Faanyagtudományi és Művészeti Kar).

PDF FMK-IMI-12-2022-SZ.pdf Hozzáférés joga: Csak nyilvántartásba vett egyetemi IP-kről nyitható meg Download (6MB)

Absztrakt (kivonat)

Biológiai kutatásokban gyakori feladat, hogy egyedeket, azok genetikai tulajdonságaik szerint, bayesi klaszterezési eljárással populációkba csoportosítunk. Erre a célra fejlesztették ki a Structure programot, amit 2000 óta használnak a kutatók erre a feladatra. A szoftver eredeti implementációja azonban a mai nagy, jellemzően akár milliós nagyságrendű adatsorokat képtelen megfelelő időben feldolgozni, így az egyes szimulációk rendkívül hosszú időt vesznek igénybe. A kutatásom célja a feldolgozási sebesség javítását szolgáló lehetőségeknek az összegyűjtése, egymással összehasonlítása, és a leglényegesebb megoldások megvalósítása teljesítményoptimalizálási célból. Többek között szóba kerülnek a különféle párhuzamosítási lehetőségek, az egyszálas gyorsítás elősegítésére tett eljárások, valamint magáról a kódbázis karbantartásáról is lesz szó.

Magyar cím

Populációgenetikai szoftver hatékonyságának növelése

Angol cím

Increasing the efficiency of a population genetics software

Intézmény

Soproni Egyetem

Kar

Faipari Mérnöki és Kreatívipari Kar (2013-tól 2021.06.30-ig: Simonyi Károly Műszaki, Faanyagtudományi és Művészeti Kar)

Tanszékcsoport/intézet

FMK - Informatikai és Matematikai Intézet

Szak

NEM RÉSZLETEZETT

Témavezető(k)

Helyi kari azonosító

FMK-IMI-12-2022-SZ

Mű típusa:	Szakdolgozat
Felhasználói azonosító szám (ID):	Máté Szabolcs Kiss
Dátum:	09 Dec 2022 11:55
Utolsó módosítás:	02 Már 2023 08:08
URI:	http://diploma.uni-sopron.hu/id/eprint/9705

Actions (login required)

Tétel nézet